手足口病发病初期，孩子会先有发热、咳嗽流涕和流口水等像上呼吸道感染一样的症状。有的孩子可能有恶心、呕吐等症状，以后手足的指及趾背部出现椭圆形或梭形的水泡，疱的周围有红晕水疱的液体清亮，水疱的长轴与皮纹是一致的。
然后水疱的中心凹陷变黄、干燥、脱掉脱屑，另外指、趾端有散在的比较坚硬的淡红色丘疹或者疱疹。
同时在口腔里，如嘴唇、舌口腔粘膜、齿龈上也有散在的水疱，但口腔里的水疱很快破溃而形成灰白色的小点或灰白色的一层膜其周围有红晕，在灰白色的膜下可以见到点状或片状的糜烂面。
1、急性起病，潜伏期3—5天，有低热、全身不适、腹痛等前驱症。口腔粘膜出现散在疼痛性粟粒至绿豆大小水疱，手足出现斑丘疹、疱疹，初起为斑丘疹，后转变为疱疹，圆形或椭圆形，约3—7毫米如米粒大小，较水痘皮疹为小，质地较硬，周围有红晕，疱内液体较少，在灰白色的膜下可以见到点状或片状的糜烂面。皮疹消退后不留瘢痕或色素沉着，如有继发感染常使皮肤损害加重。
2、除手足口外，亦可见于臀部及肛门附近，偶可见于躯干及四肢，数天后干涸、消退，皮疹无瘙痒，无疼痛感。小儿手足口病的疹子较少出现在躯干及面部，手足口病初期症状一般7天左右就能消退，不会造成瘢痕，更不会留下印迹。
小儿手足口病是一种病情较轻的自愈性疾病，绝大部分患儿预后较好，手足口病初期症状患儿可合并心肌炎、脑炎、但这种可能很小。
整个病程大约在1周左右结束，一般不会并发什么严重的后果，只要护理得当，不会在皮肤上留下任何色素痕迹或疤痕。
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